根据手术室无菌程度将手术室分为5类：

(1)一类手术室相当I级洁净手术室(手术区100级，周边区1000级)，也称无菌净化手术室。多用于神经外科、心脏、脏器移植、全关节置换、眼科、大面积烧伤植皮等深部重大手术。这类手术不得有产生感染的因素。

(2)二类手术室相当于II级洁净手术室(手术区1000级，周边区10000级)，即一般无菌手术室。多用于脾、肾、肺等脏器切除、闭合性骨折切开复位等。这类手术，外部条件属无菌，但在手术过程中，因内部因素可能发生感染。

(3)三类手术室相当于III级洁净手术室，多用于本身已感染的有菌手术，如胃、胆囊、阑尾手术等，但手术过程是在无菌条件下进行的。

(4)IV类手术室也是用于有菌手术，如创口已严重化脓和感染。

(5)五类手术室为负压手术室，应用于有传染性的手术，如全同绿假单胞菌、气性坏疽、破伤风、MRSA等细菌的感染伤口的手术。病人自身有菌，感染力强，散发大量传染病菌，对环境严重污染、危害大，故应隔离，空调系统也应分开设置。

手术室的数量、等级依医院性质、规模、级别和财力而定。我国规定，100张床位，需4-5间手术室，有菌无菌手术室分开。综合性医院I级手术室间数不应超过洁净手术室总间数的15%，专科医院视需要而定。